中国科学家独立自主绘制出水稻基因组工作框架图，使人类第一次在基因组层面“认识”水稻，这一消息在国际科学界引起强烈反响。一些权威科学家给予高度评价，认为中国已进入世界生物学研究的前沿。
    
    《科学》杂志在社论中指出：“这是一篇开创性的论文，对人类的健康与生存具有全球性的影响，我们对作者对科学和人类的里程碑性的贡献表示热烈的祝贺！”
    
    《科学》杂志论文评审人说：“这一论文描述了对科学和各国都有非常重要意义的工作。据本人之见，这一里程碑性的论文说明中国已经进入生物学研究的前沿，证明中国科学家已在同一水平上，并具有国际性的竞争能力。”
    
    国际人类基因组计划主要负责人柯林斯教授说：“祝贺你们新构建的水稻基因组工作框架图，这是基因组研究的重大里程碑。这不仅是由于水稻在农业上的重要性，而且是由于水稻能提供其他植物的重要生物学基本知识。”这位人类基因组计划“掌门人”说，“你们开发的识别重复序列并进行全基因组组装的软件更值得祝贺！”
    
    美国麻省理工学院怀特·黑德研究所基因组研究中心主任兰德博士说：“这一论文是一个里程碑的成果。水稻作为农作物的重要性与水稻基因组序列对生物学与农业的重要性怎么估计都不过分。这是第一个覆盖水稻大部分基因组的序列图。你们为公众提供的序列将受到科学界的尊敬与感谢。此外，这么大的一个基因组的组装成功是技术上的重要进展。它将引起全世界基因组学研究小组的浓厚兴趣。”
    
    美国西雅图华盛顿大学人类基因组中心主任奥尔森说：“这一成果使‘北京华大’成为全球基因组中心中的佼佼者，世界上只有少数几个中心具备进行如此规模的工作所需要的技术与能力。”
    
    丹麦皇家农业与畜牧大学教授福拉德汉姆说：“他们加入国际人类基因组计划很晚，但是已经做出了突出的贡献。这证明他们已经具备了与全世界任何一个实验室相媲美的实力。”